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R語言與Bioconductor生物信息學(xué)應(yīng)用
編號(hào)：
CY247
書 號(hào)：978-7-5433-3360-4
開 本：16開
出版時(shí)間：2014-01-01
作 者：高山，歐劍虹，肖凱
定 價(jià)：58.00?
產(chǎn)品詳情
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- 商品名稱: R語言與Bioconductor生物信息學(xué)應(yīng)用
- 商品編號(hào): CY247
<p>書 號(hào)：978-7-5433-3360-4<br/> 開 本：16開<br/> 出版時(shí)間：2014-01-01<br/> 作 者：高山，歐劍虹，肖凱<br/> 定 價(jià)：58.00?</p>
《R語言與Bioconductor生物信息學(xué)應(yīng)用》既是一本R語言的書，又是一本生物信息學(xué)的書，從實(shí)際課題及如何解決問題的思路出發(fā)，結(jié)合基礎(chǔ)知識(shí)，偏重解決問題的流程，選用簡單但功能強(qiáng)大的R語言，把講解延伸到具體程序代碼，讓讀者經(jīng)歷整個(gè)課題研究過程，學(xué)會(huì)分析并解決問題，從而加深學(xué)習(xí)印象，并真正把所學(xué)知識(shí)轉(zhuǎn)化為技能。
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目錄
第一章 R基礎(chǔ)知識(shí)
1.1 什么是R
1.2 R的下載與安裝
1.3 R語言快速入門
1.4 一些簡單的語法知識(shí)
1.5 本章源代碼詳解及小結(jié)
第二章 生物信息學(xué)基礎(chǔ)知識(shí)
2.1 中心法則——生物信息流
2.2 測序與序列分析
2.3 基因表達(dá)分析
2.4 注釋、統(tǒng)計(jì)與可視化
第三章 R在生物信息學(xué)中的簡單應(yīng)用
3.1 一個(gè)序列分析課題
3.2 用R包（非Bioconductor）實(shí)現(xiàn)課題
3.3 用R包（Bioconductor）再實(shí)現(xiàn)課題（方法一）
3.4 用R包（Bioconductor）再實(shí)現(xiàn)課題（方法二）
第四章 Bioconductor簡介
4.1 什么是Bioconductor
4.2 Bioconductor的分類介紹
4.3 從R到Bioconductor的跨越
第五章 Bioconductor分析基因芯片數(shù)據(jù)
5.1 快速入門
5.2 基因芯片基礎(chǔ)知識(shí)
5.3 基因芯片數(shù)據(jù)預(yù)處理
5.4 基因芯片數(shù)據(jù)分析
5.5 芯片處理實(shí)際課題一
5.6 芯片處理實(shí)際課題二
5.7 芯片處理實(shí)際課題三
第六章 Bioconductor分析RNA-seq數(shù)據(jù)
6.1 示例課題介紹
6.2 高通量測序基礎(chǔ)知識(shí)
6.3 RNA-seq技術(shù)的特點(diǎn)
6.4 RNA-seq數(shù)據(jù)預(yù)處理
6.5 RNA-seq數(shù)據(jù)分析
第七章 R的高級(jí)語法與如何創(chuàng)建R包
7.1 R的高級(jí)語法
7.2 創(chuàng)建及發(fā)布自己的R/Bioconductor包
7.3 R包結(jié)構(gòu)
附錄A 進(jìn)一步學(xué)習(xí)的資源
附錄B R常用函數(shù)
附錄C R的內(nèi)存管理和幫助系統(tǒng)
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高山，天津大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院副教授。1995年考入國防科技大學(xué)電子工程學(xué)院，后轉(zhuǎn)入生物信息領(lǐng)域，2010年畢業(yè)于南開大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，取得生物信息學(xué)博士學(xué)位。留美期間主要科研工作是在美國堪薩斯大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)中心和康奈爾大學(xué)BTI植物研究所完成。2013年通過天津市第八批"千人計(jì)劃"青年項(xiàng)目)進(jìn)入天津大學(xué)工作。歐劍虹，1997年考入武漢大學(xué)微生物專業(yè)學(xué)習(xí)，后進(jìn)入日本大阪大學(xué)學(xué)習(xí)，2009年畢業(yè)于大阪大學(xué)，取得信息科學(xué)與技術(shù)博士學(xué)位。2011年進(jìn)入麻省州立大學(xué)醫(yī)學(xué)院從事生物信息研究工作。肖凱，職業(yè)數(shù)據(jù)分析師，"數(shù)據(jù)科學(xué)與R語言"博客博主，現(xiàn)供職于SupStat統(tǒng)計(jì)咨詢公司，專注于R語言與大數(shù)據(jù)挖掘方面的研究。
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國內(nèi)首部與SCI文章緊密結(jié)合的生物信息書籍。大量實(shí)際課題來自發(fā)表的SCI文章，全部都是"真槍實(shí)彈"，不杜撰所謂"實(shí)際應(yīng)用"。
通過前期網(wǎng)上調(diào)研，了解并在書中突出大多數(shù)讀者普遍關(guān)心而又難尋相關(guān)資料的問題。
從實(shí)際課題出發(fā)，提出解決問題的思路，結(jié)合原理把講解延伸到具體程序代碼。所見即所得，學(xué)到的知識(shí)可以通過簡單編程加以實(shí)現(xiàn)。三板斧法學(xué)習(xí)R語言，讓無基礎(chǔ)的人也能輕松編程。
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在面對(duì)各種復(fù)雜的數(shù)據(jù)問題時(shí)，如果能用幾行代碼就輕松實(shí)現(xiàn)使用者的想法而無須了解其底層的實(shí)現(xiàn)細(xì)節(jié)，那么使用者就可以從繁忙的編程工作中解脫出來而投入更多的精力到應(yīng)用領(lǐng)域。R就是基于此目的設(shè)計(jì)的程序語言，并已在業(yè)界盛行。越來越多的公司（包括谷歌、輝瑞和美國銀行等業(yè)界巨頭）和學(xué)術(shù)界的數(shù)據(jù)分析師開始使用R語言，歐美各大名校也都將R語言列為數(shù)據(jù)分析課程的必修語言。借用谷歌首席經(jīng)濟(jì)學(xué)家Hal Varian的一句話來評(píng)價(jià)R："R語言的美在于你稍做修改，就可以用它來達(dá)到不同的使用目的，它預(yù)置了各種可用的擴(kuò)展包，使你站在巨人的肩膀上工作。"
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